• фундаментальные эколого-экономические и правовые проблемы обеспечения экологической безопасности;
• фундаментальные основы оценивания и обеспечения здоровья экосистем, методы диагностики их состояния и оперативного предупреждения о возникновении угроз экологической безопасности;
• фундаментальные и прикладные основы процессов трансформации и миграции экотоксикантов в окружающей среде;
• фундаментальные и прикладные исследования жизненных циклов природно-хозяйственных систем и объектов прошлого экологического ущерба, методы и процессы реабилитации нарушенных и загрязненных экосистем и техногенных ландшафтов, системы обращения с отходами.
Основные направления исследований зафиксированы в Уставе СПб ФИЦ РАН